食用菌能在富含纤维素的物质上生长繁殖，是因为食用菌在生长过程中，能产生大量分解纤维素、半纤维素的复合酶，降解木质素的过氧化酶和漆酶，把农作物秸秆等附产物中的纤维素、半纤维素和木质素分解成葡萄糖、醌类化合物等成份供给食用菌和菌丝体生长繁殖，它的营养价值得到显著改善。
用稻草、麦秸、干牛粪以3：2：5的比例组成的培养基，采蘑菇5批后晒干粉碎的菌糠，粗蛋白为10.2%、粗纤维9.32%、粗脂肪0.12%、无氮浸出物48%、钙3.24%、磷2.1%、赖氨酸1.2%、色氨酸0.8%、蛋氨酸十胱氨酸1.2%。
以木屑或砻糠为主要原料栽培香菇的菌糠，它们的粗蛋白、粗脂肪、粗纤维、矿物质和无氮浸出物分别为8.67%、6.2%、30.58%、7.93%、42%和7.82%、8.9%、25.63%、2.79%、33.3%；
以玉米芯为原料栽培香菇的菌糠的营养含量粗纤维从36.1%下降到24.4%，木质素从13.2%下降到9.5%，粗蛋白从2%上升到9.5%。
棉籽壳菌糠中含粗蛋白质13.06%、粗纤维31.56%、粗脂肪4.20%、粗灰分10.89%、无氮浸出物33.01%、钙0.21%、磷0.07%。
可见，食用菌培养基通过食用菌菌体的生物固氮作用、酶解作用等一系列生物转化过程，粗蛋白质、粗脂肪含量均比不经过食用菌发酵前明显提高，纤维素、半纤维素、木质素和抗营养因子均已被不同程度的降解，同时还产生了多种糖类、有机酸类和生物活性物质。