凤梨酵素是一种可以口服的蛋白分解酵素，主要功效在于帮助消化，我们知道饭后吃点凤梨可以帮助消化，而空腹不宜吃凤梨，原因就是其中的凤梨酵素可以消化蛋白质，研究发现，手术后吃些凤梨酵素可以帮助伤口的复原，防止伤口的皮下出血，对于抽脂类的手术特别有效。
凤梨中含有丰富的蛋白酶，这是其主要酵素，另外还含有磷酸酶、过氧化酶等。凤梨酵素在医学临床上有许多功能，如抗发炎、改善关节与肌肉伤害、清除伤口坏死组织、降低关节发炎病痛、改善消化道及呼吸道功能等。另外，研究还发现，其有增强免疫力及抑制癌细胞生长等功效。
由于台湾的法规中限制食品不能强调疗效，所以市售的食品级酵素都不能陈述医学功效。但事实就是事实，站在学术立场我们不得不讨论起医学上疗效，政府的鸵鸟心态及落后法规实在应该修改，否则台湾生物技术发展必大受影响。