外形特征
壳形不规则，大小、厚薄因种而异;左壳或称下壳较大而凹，附着在岩石或石板上，右壳或称上壳较小而平，掩覆如盖。无足及足丝。闭壳肌仅有1个，外套膜外长着多数小触手，是感觉器官。
牡蛎的两壳形状不同，表面粗糙，暗灰色；上壳中部隆起；下壳附著于其他物体上，较大，颇扁，边缘较光滑；两壳的内面均白色光滑。两壳于较窄的一端以一条有弹性的韧带相连。壳的中部有强大的闭壳肌，用以对抗韧带的拉力。壳微张时，藉纤毛波浪状运动将水流引入壳内（每小时流过的水量可达2～3加仑），滤食微小生物。
牡蛎（ostreagigastnunb）及其近缘动物的全体，是海产贝壳。在亚热带、热带沿海都适宜蚝的养殖，我国分布很广，北起鸭绿江，南至海南岛，沿海皆可产蚝。蚝乃软体有壳，依附寄生的动物，咸淡水交界所产尤为肥美。
若一粒外物侵入牡蛎的壳内，牡蛎即分泌珍珠质将外物层层包起而形成珍珠。食用牡蛎产生的珍珠不光泽，价值不高。只有少数东方的种类，特别是波斯湾珠母贝（Meleagrina vulgaris）所产的珍珠质量最高。珠母贝主要分布于8～20噚（48～120尺）的海水深处。珍珠多采自5岁以上的牡蛎，用手工方法将小粒珍珠植入珠母贝内，便在其周围形成养殖的珍珠，大多珍珠养殖在日本或澳大利亚沿岸水域进行。
由中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院领导的一个国际研究小组完成了对太平洋牡蛎（Pacific oyster）的测序、组装与分析，这是第一个测序的软体动物基因组，将有助于填补我们对于种类丰富而较少研究的软体动物家族的了解空白。这一研究在线发布在《自然》（Nature）杂志上，揭示了牡蛎对高压环境的独特适应以及贝壳形成的复杂机制。
在这项研究中，研究人员采用短读（short reads）结合“分而治之”的fosmid合并策略测序并组装了太平洋牡蛎基因组。这是深圳华大基因研究院开发的一种新方法，可用于研究具有高水平杂合性和/或重复序列的基因组。经过数据处理，组装牡蛎基因组大约为559Mb，总共有大约28,000个基因。