节节麦有它自身的发生特点，生命力强、繁殖快、传播广、防治难，这就对防治带来了很大的困难，应当采用人工防治与化学防治相结合的方法，采取“预防为主，综合防治”的防治策略。
防止机械带种传播：针对收割机跨区作业带种问题，最有效的防治方法就是不用有大量节节麦发生区域进行过收割操作的机器进行异地收割。如果必须跨区作业，最好是对收割机下地前进行彻底清理，以防节节麦种子的传播。
精选种子：节节麦发生的又一大传播途径就是种子传播，节节麦种子与普通小麦种子极为相似，只比普通麦种小一些，这就要求在播种前要进行认真筛选，去除节节麦种子。同时，加强种子质量监督检查，严格把好种子检验检疫关，从根本上杜绝节节麦种子的传播。
人工拔除：人工拔除是防治节节麦最有效的办法，节节麦的生命力极强，极易生长繁殖，在苗期进行人工拔除的时候一定要连根一次性拔除，不能只拔地上部，这样就会使剩余根部继续生长、分蘖产籽。拔除后及时带出田外在阳光下暴晒致其彻底死亡；成株期要在其籽粒成熟之前进行一次性拔除，防止拔除时籽粒脱落造成大量传播，同时要将拔除的植株全部带出田外进行集中销毁，不能在田边路旁堆积，以防节节麦种子再次传入田间。
施用腐熟有机肥：有机肥一定要彻底腐熟，采用高温堆肥，充分发酵，利用高温杀死有害杂草种子，不能将没有充分腐熟的有机肥直接施入田间，以防节节麦种子随肥料进行传播。
深耕灭草：节节麦种子主要集中在3-8厘米的土层中，这是较为适合的土壤深度，采用深耕技术可以打破节节麦种子的生存环境，使之失去正常的生长条件，发芽受阻。深耕要在前茬作物收获后小麦播种进行，通过机械深耕将节节麦种子翻入土层20cm以下，抑制其发芽生长，最终坏死。
轮作倒茬：节节麦发生特别严重的地块建议轮作倒茬，可与春玉米、油菜、棉花等作物进行轮作，破坏节节麦的生长环境。
化学除草：世玛乳油是防治节节麦的一种有效化学药剂。药剂防治节节麦最佳时间在10月底至11月上旬，根据药剂使用说明采用冬前用药。这种药剂不能在优质麦上使用，以免发生药害。在普通品种麦田使用时一定要施足底肥，促进苗壮，以避免用药后出现的麦苗黄化和蹲苗现象，减轻对麦苗生长的影响。