甲鱼是我国传统的上等中药材，具有极高的药用价值，是滋阴补肾的佳品，有滋阴壮阳、软坚散结、化瘀和延年益寿的功能。经常食用甲鱼，体内的阴精就能不断得到加强，并起到滋阴潜阳的作用，使人体阴阳恢复到相对平衡的状态，从而达到强身健体、祛病延年的效果。尤其适宜于中老年及体质虚弱者进补。
甲鱼全身是宝，其肉、甲、血、头、胆、卵、脂肪均可入药。甲鱼对肝硬化、脾肿大有治疗作用，还能调节免疫功能，提高淋巴细胞转化率，促进骨髓造血功能；甲鱼血可作补血剂，将甲鱼血和蜂蜜混合后让糖尿病患者饮用，可降低血糖值；甲鱼卵可治久疟，久痢。甲鱼壳晒干磨粉，也有其一定药用作用。
1. 甲鱼肉及其提取物能有效地预防和抑制肝癌、胃癌、急性淋巴性白血病，并用于防治因放疗、化疗引起的虚弱、贫血、白细胞减少等症；
2. 甲鱼亦有较好的净血作用，常食者可降低血胆固醇，因而对高血压、冠心病患者有益；
3. 甲鱼还能“补劳伤，壮阳气，大补阴之不足”；
4. 食甲鱼对肺结核、贫血、体质虚弱等多种病患亦有一定的辅助疗效。
食物相克
甲鱼：甲鱼不宜与桃子、苋莱、鸡蛋、猪肉、兔肉、薄荷、芹菜、鸭蛋、鸭肉、芥末、鸡肉、黄鳝、蟹一同食用。
骨碎补：1. 骨碎补忌羊肉、羊血、芸苔菜。2. 不宜与风燥药同用。
山药(干)：山药恶甘遂、大戟，不可与碱性药物同服。
枸杞子：枸杞一般不宜和过多茶性温热的补品如桂圆、红参、大枣等共同食用。