野生胭脂鱼肌肉中水分、粗灰分、粗蛋白含量均显著高于人工养殖胭脂鱼，而含肉率和粗脂肪含量却显著低于人工养殖胭脂鱼。野生和人工养殖胭脂鱼的氨基酸组成基本一致，均含有17种氨基酸(色氨酸未测)，必需氨基酸指数(EAAI)分别为70.39和67.02。根据氨基酸分(AAS)，胭脂鱼的第一限制性氨基酸为Val;根据化学分(CS)，胭脂鱼的第一限制性氨基酸为Met+Cys。野生胭脂鱼的ΣSFA(44.23%)显著高于人工养殖胭脂鱼(31.07%)，而ΣMUFA(32.07%)却显著低于人工养殖胭脂鱼(49.50%)ΣPUFA的差异则不显著，分别为23.65%和23.11%。