作用
决定酵素功能的一个非常重要的方面是其是否有科学的主材配方，用何种主材才能决定其有哪些功能，不是种类越多越好，种类多了，单个成分达不到需求阈值，等于没有功能。
由于是发酵的产物，有些产品中包含着益生菌以及众多微生物，在一定条件下，这些益生菌和微生物可以起到促进肠道蠕动的作用，因此可以说，酵素本身并不具有通便减肥的功能，即使酵素产品在减肥瘦身方面被证明有效，也并不是酵素在起作用，而是发酵产物中的益生菌、微生物以及其他产品添加物的功效。
通过发酵，原料组织受到微生物酶的作用而崩解，原料细胞中的功能性成分得以充分释放出来并发生小分子化而变得容易为人体吸收，有些酵素原料中有一些本身就是草本药材，经过发酵转化可进一步增加其功效，降低其副作用或产生具有抗癌、降血脂、抗氧化、提高机体免疫功能的物质，一些功能性物质例如有抗氧化作用的黄酮(黄酮类、异黄酮、皂苷等)通常以糖苷形态存在，因分子量大而人体难以吸收，只有经过肠道微生物作用后，糖基被水解而除去，苷元(配基)才易被人体吸收而发挥作用 。一些中药之所以需要炮制(用蒸、煮、熬、煎、炼、浸等方法)来增强药效、降低毒副作用其原因在此，而发酵也是一种炮制方法。
功效
酵素近些年应该是属于一个较热的词，特别是在保健行业或营养行业。最早来说，在我们国家酵素就是所说的酶，但是最近在日本和台湾，酵素跟酶是两个概念。实际上酵素就是用小麦、米的胚芽以及大豆等植物原料，用乳酸菌或者酵母发酵以后所成的一些发酵食品。吃完后是有益于健康的，主要是提取物当中含有大量的黄酮类、植物色素、超氧化物歧化酶；这些活性成分，可以消除人体中的一些对于健康有害的活性氧；得益于乳酸菌和酵母对肠道微生态的保护作用，可以抑制大肠中的一些腐败或者胺类毒素的生成。植物原料中的各种维生素、氨基酸和矿物质还可提供各种营养，所以这种酵素制品现在在营养界还是有一定影响力的。实际上它也就是和大家所熟悉的，与豆酱、啤酒、黄酒、醋、葡萄酒这些植物发酵制品相似。它的制造离不开酶的作用，所以称之为酵素，但不是作为生物催化剂的那种酶的酵素。它的功能现在还存在着不同的看法，但是很多的临床应用表明，很多酵素产品的营养成分，如其中的过氧化物歧化酶，还包括发酵的多种维生素，还有一些菌种的发酵产生的对肠道有益的一些东西，应该说对清除体内的垃圾，提高抗氧化能力还是有一定作用的。在动物试验当中，对血脂、胆固醇、低密度脂蛋白都有一定的调理作用，但在人群当中的作用还需要更多的应用和观察。
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